T/LTIA 13—2021 基因检测服务中微生物组数据共享规范-团体标准
目录
| 标准详细信息 | |
|---|---|
| 标准状态 | 现行 |
| 标准编号 | T/LTIA 13—2021 |
| 中文标题 | 基因检测服务中微生物组数据共享规范 |
| 英文标题 | Specification for the interoperability of microbiome data in genetic testing services |
| 国际标准分类号 | 07.100.01 微生物学综合 |
| 中国标准分类号 | |
| 国民经济分类 | Q849 其他卫生活动 |
| 发布日期 | 2021年11月23日 |
| 实施日期 | 2021年11月30日 |
| 起草人 | 林宇翔、翦敏、蔡杰伦、王小涵、蔡锴晔、吕春杰、王奇、刘小燕、黎宇翔、李彦涛、曾俊杰、徐驰、吴静静、祁乐、陈娟娟、陶勇、单日强、刘姗姗、李陶莎、颜妙丽、武庆超、王萌萌、吴昊、李倩一、骆顺 |
| 起草单位 | 深圳华大生命科学研究院、深圳华大智造科技股份有限公司、深圳华大基因股份有限公司、兰州大学第二医院、北京量化健康科技有限公司、北京知因新生活细胞生物科技有限公司、 青岛华大智造科技有限责任公司、深圳生命科技产学研资联盟、深圳华大基因科技有限公司 |
| 范围 | 本文件规定了在基因检测服务中，微生物组在数据处理节点间的数据共享规范、元数据及数据交换格式。 本文件适用于基因检测服务中微生物组数据。 |
| 主要技术内容 | 在本标准制定过程中，随着研究的深入，先后完成标准讨论稿、草案和标准征求意见稿，标准内容不断完善，并趋于科学合理。根据需要，本标准的主要技术内容确定为： 在术语和定义中，对元数据，微生物组，宏基因组学，扩增子，生物观测矩阵格式，数据生产，数据分析，分析级数据，数据存储，数据服务，基因丰度，分类学丰度，功能丰度，相对丰度，操作分类单元，FASTQ格式，TSV格式等进行了定义。 在微生物组数据共享和交换流程中，描述了微生物组数据的生产、传输、使用等过程。将此过程分为四个环节：数据生产、数据分析、数据存储和数据服务，并描述各环节细节及注意要点。 在微生物组数据元数据中，标准根据数据产生的环节，将元数据分为：样本信息关联的元数据、测序数据关联的元数据和分析级数据关联的元数据三个部分，规范了各部分微生物组数据交换中的常用元数据和最低要素。 在微生物组数据格式中，标准规范了微生物组数据在各个过程环节中的数据格式，介绍了常用格式作为参考。根据产生的环节，微生物组数据分为原始数据和分析级数据。高通量测序方法的原始数据为FASTQ，分析级数据指原始数据经生物信息学方法分析所得的微生物组成分组成信息，并提出TSV（制表格分割文本）和BIOM格式可作为分析级数据文件存储使用的文件格式。此外，也提出了在网络交互场景下的建议数据结构。 |
| 是否包含专利信息 | 否 |
| 标准文本 | 不公开 |
| 团体详细信息 | |||
|---|---|---|---|
| 团体名称 | 深圳市生命科技产学研资联盟 | ||
| 登记证号 | 51440300064995609N | 发证机关 | 深圳市民政局 |
| 业务范围 | 会员交流，会员培训，推动生物基因领域跨行业联动发展，提升生物基因核心竞争力（具体详见该会《章程》） | ||
| 法定代表人/负责人 | 汪建 | ||
| 依托单位名称 | |||
| 通讯地址 | 深圳市南山区朗山路通产集团8栋2楼 | 邮编 : 518057 | |