T_LTIA 26—2024 基于SeqFD技术的物种鉴定技术规范-团体标准
目录
| 标准详细信息 | |
|---|---|
| 标准状态 | 现行 |
| 标准编号 | T/LTIA 26—2024 |
| 中文标题 | 基于SeqFD技术的物种鉴定技术规范 |
| 英文标题 | Specification for species identification based on SeqFD technology |
| 国际标准分类号 | 07.080 |
| 中国标准分类号 | |
| 国民经济分类 | M733 农业科学研究和试验发展 |
| 发布日期 | 2024年09月12日 |
| 实施日期 | 2024年10月01日 |
| 起草人 | 夏志强、李小强、周红梅、李启沅、吴静静、华聪、邹枚伶、魏晓锋、游丽金、王伟文、李涛、余乐俊、夏勉、黄河飞、孙建波、何沛欣、王博、王逸丛、谢伟、武庆超、骆顺、李陶莎 |
| 起草单位 | 海南大学三亚南繁研究院、深圳华大生命科学研究院、深圳华大智造科技股份有限公司、海南省种业实验室、海南大学三亚研究院、武汉华大生命科学研究、三亚海古纪生物科技有限公司、深圳市生命科技产学研资联盟 |
| 范围 | 本文件规定了基于SeqFD测序技术物种鉴定的原理、试剂或材料、仪器设备、实验步骤、结果分析。 本文件适用于与农业相关的植物和动物样本，如水稻、木薯、甘蔗、马铃薯、猪和牛等物种鉴定。 |
| 主要技术内容 | 设计含有简并碱基的引物，构建样本基因组测序文库，利用多重聚合酶链式反应（PCR）进行文库扩增和高通量测序，分析测序数据，获得比对结果和鉴定结论。 通过使用含有简并碱基的引物，构建样本基因组测序文库，进行高通量测序。引物的核心部分由4个稳定不变的碱基构成。另外，为了增加引物的灵活性和适应性，设计中还包括了3个可变化的碱基（NWN\NYN的组合），形成了所谓的弹性序列。这种设计使得引物能够适应并结合到基因组中的多种不同序列，从而增加了测序的广度和深度。这些碱基构成的引物能够结合基因组的内含子、编码序列、启动子上游2000?pb以及非基因区域的DNA序列。 通过使用seqtk工具随机筛选测序数据和格式转换。然后使用BLAST工具将转换后的数据与NCBI的NT数据库中的序列进行快速比对，找出潜在的匹配区域，然后计算这些区域的相似性得分，返回评分最高的匹配序列。统计匹配序列归属的物种，并通过本文件的计算公式和规则，获得样本鉴定结论。 |
| 是否包含专利信息 | 是 |
| 标准文本 | 查看 |
| 团体详细信息 | |||
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| 团体名称 | 深圳市生命科技产学研资联盟 | ||
| 登记证号 | 51440300064995609N | 发证机关 | 深圳市民政局 |
| 业务范围 | 会员交流，会员培训，推动生物基因领域跨行业联动发展，提升生物基因核心竞争力（具体详见该会《章程》） | ||
| 法定代表人/负责人 | 汪建 | ||
| 依托单位名称 | |||
| 通讯地址 | 深圳市南山区朗山路通产集团8栋2楼 | 邮编 : 518057 | |